การคัดเลือก, การเก็บตัวยา
ในการปรุงยาแผนโบราณ ผู้เป็นเภสัชกรแผนโบราณ
จะปรุงยาให้ได้คุณภาพดีและยามีสรรพคุณดีนั้นจะต้องมีความรู้ความสามารถที่จะพิจารณาคัดเลือกตัวยาสมุนไพรได้อย่างถูกต้อง
และมีสรรพคุณดี โดยมีหลักเกณฑ์ และวิธีการดังต่อไปนี้

1. ชนิดของตัวยา
การเก็บตัวยานั้น ต้องแน่ใจเสียก่อนว่า
ตัวยานั้นถูกต้องถูกชนิดกับชื่อกับชื่อของตัวยาในตำรับยาแผนโบราณ
ตัวยาบางชนิดมีหลายๆ ชื่อ
ซึ่งต้องอาศัยประสบการณ์และภูมิความรู้ของเภสัชกรเอง ที่จะต้องรู้ว่า
ชื่อนี้ ชนิดนี้ มีลักษณะต้น ใบ ลูก ดอก ราก เป็นอย่างไร

2. คุณภาพ
ตัวยาบางชนิด ถูกเก็บไว้นาน คุณภาพของตัวยาก็เสื่อมไปตามกาลเวลา
หรือไม่มีสรรพคุณตามที่ระบุไว้
ซึ่งเภสัชกรจะต้องศึกษาถึงระยะเวลาการเก็บรักษาตัวยาต่างๆ
ต้องพิถีพิถันคัดเลือก ดูตัวยาว่าเก่าหรือใหม่

3. ความสะอาด
ตัวยาที่นำมาปรุงยา ต้องมีความสะอาดไม่ว่าจะเป็นตัวยาสดหรือแห้งก็ตาม
ต้องทำความสะอาดให้ปราศจากสิ่งปนเปื้อนต่างๆ เช่น ดิน ฝุ่นละออง เชื้อรา
มูลสัตว์ รวมถึงการเก็บยาเพื่อสำหรับใช้ในโอกาสต่อไป
ขึ้นอยู่กับวิธีการเก็บรักษานั้นเป็นประการสำคัญ
ถ้าเก็บยาไว้ถูกวิธีโดยไม่ถูกแสงแดดหรือของร้อนจัด อากาศชื้น ถูกน้ำค้าง
น้ำฝน เก็บรักษาไว้ในที่อากาศถ่ายเทดี ปลอดโปร่ง
ก็อาจจะเก็บไว้ได้นานสรรพคุณไม่เสื่อม ใช้ได้นานขึ้นกว่ากำหนด